RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM124AQ86V42 546 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NAGSQ8N159 534 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GLYATL1Q969I3 302 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 OTUB2Q96DC9 234 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DOHHQ9BU89 302 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RAET1GQ6H3X3 334 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC81Q6ZN84 652 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 APH1BQ8WW43 257 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HRASLS5Q96KN8 279 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MYADMQ96S97 322 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM129BQ96TA1 746 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GABARAPL3Q9BY60 117 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RASSF1Q9NS23 344 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS4AQ9UN37 437 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MGAT4DA6NG13 374 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NADKO95544 446 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NTRK1P04629 796 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCE2Q6PIF2 218 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MINDY2Q8NBR6 621 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NEIL2Q969S2 332 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH7O60245 1069 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMB9P28065 219 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 AQP1P29972 269 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GJA4P35212 333 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MVDP53602 400 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 VBP1P61758 197 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS13P62277 151 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DPPA4Q7L190 304 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ENTHD1Q8IYW4 607 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf65Q8NCR3 313 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR156Q8NFN8 814 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 BTBD2Q9BX70 525 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GPATCH2Q9NW75 528 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GULP1Q9UBP9 304 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RRM2P31350 389 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINB10P48595 397 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SELENOWP63302 87 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TEAD4Q15561 434 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.476e-13■■■■■ 31.9
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3BP4Q9P0V3 963 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNE2Q9Y6J6 123 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NFATC1O95644 943 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 C6P13671 934 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GRK3P35626 688 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 OPRD1P41143 372 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK9P45984 424 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 LSM3P62310 102 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC74AQ0VAA2 488 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DGCR6Q14129 220 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF385BQ569K4 471 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PERM1Q5SV97 790 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ERAP2Q6P179 960 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MED27Q6P2C8 311 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4A15Q8NGL6 344 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CXorf40BQ96DE9 158 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SFXN1Q9H9B4 322 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ATAD3AQ9NVI7 634 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SERGEFQ9UGK8 458 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP4P12644 408 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GDI1P31150 447 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CSNK2BP67870 215 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RUBCNLQ9H714 662 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TM7SF3Q9NS93 570 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM184CQ9NVA4 438 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFAF4Q9P032 175 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM247A6NEH6 219 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SOD1P00441 154 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms