RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NEU3Q9UQ49 428 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1CQ13936 2221 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf105B2RV13 164 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM13O60858 407 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNH1O95259 989 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRB1P04280 392 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRLHRP49683 370 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A1P53985 500 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SIRPAP78324 504 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF844Q08AG5 666 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLAMF1Q13291 335 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CHI3L2Q15782 390 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CYP51A1Q16850 503 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.23□□□□□ -1.737e-6■■□□□ 14.4
PTPRC-201ENST00000348564 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 METRNLQ641Q3 311 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAMSTRQ6ZN01 415 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PROSER1Q86XN7 944 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GATSQ8NAP1 163 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CENPTQ96BT3 561 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PKP4Q99569 1192 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EBPLQ9BY08 206 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TEX101Q9BY14 249 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANGPT4Q9Y264 503 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CKAP5Q14008 2032 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARID1AO14497 2285 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 JMJD1CQ15652 2540 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARNTLO00327 626 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EFSO43281 561 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IL2RAP01589 272 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN4P29074 926 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CLCN7P51798 805 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LIMK1P53667 647 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOVP59797 346 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNEQ04844 493 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDC20Q12834 499 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNAB2Q13303 367 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2H2Q13888 395 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf22Q49AR2 442 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PACS1Q6VY07 963 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT12Q8IXK2 581 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRR22Q8IZ63 422 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TEX12Q9BXU0 123 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRODH2Q9UF12 536 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LILRB5O75023 590 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 E2F6O75461 281 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SNX4O95219 450 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NELFEP18615 380 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CRATP43155 626 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 AGTR2P50052 363 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SSR4P51571 173 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GYS2P54840 703 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TLE1Q04724 770 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SERTAD2Q14140 314 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PAQR7Q86WK9 346 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CDK20Q8IZL9 346 aa4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms