RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 AGRPO00253 132 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 UGDHO60701 494 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 UPK1BO75841 260 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SOX14O95416 240 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DLGAP3O95886 979 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RECKO95980 971 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ASMTP46597 345 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PRIM2P49643 509 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TPTEP56180 551 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C21orf58P58505 322 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TLE2Q04725 743 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ELP6Q0PNE2 266 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ST3GAL4Q11206 333 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MICAQ29983 383 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF284Q2VY69 593 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF404Q494X3 552 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SPIN4Q56A73 249 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.96□□□□□ -1.29
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PTPRR-202ENST00000342084 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SPATC1Q76KD6 591 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 STX19Q8N4C7 294 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 POC5Q8NA72 575 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OR56A3Q8NH54 315 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GLYATL1Q969I3 302 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 AP2M1Q96CW1 435 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PSD2Q9BQI7 771 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ABCG4Q9H172 646 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 REEP4Q9H6H4 257 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 BRF2Q9HAW0 419 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C5AR2Q9P296 337 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PLXNA2O75051 1894 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TRBC2A0A5B9 178 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 AGAP5A6NIR3 686 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 H3BM21 787 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KPNA5O15131 536 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ATG13O75143 517 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KCNK2O95069 426 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf105O95561 183 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GASTP01350 101 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 IL3P08700 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FURINP09958 794 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ELFN1P0C7U0 828 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NPPBP16860 134 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ALOX12P18054 663 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GABRB1P18505 474 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PTGER1P34995 402 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OPRD1P41143 372 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PRLHRP49683 370 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PPP5CP53041 499 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NTHL1P78549 312 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CDK6Q00534 326 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MESP2Q0VG99 397 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SELENBP1Q13228 472 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KCNC3Q14003 757 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DMC1Q14565 340 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MED22Q15528 200 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.96□□□□□ -1.3
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