RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ULK1O75385 1050 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 RDH16O75452 317 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ZGLP1P0C6A0 271 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 WT1P19544 449 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 SSPNQ14714 243 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD42Q8N9B4 389 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 STT3BQ8TCJ2 826 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 NMRK1Q9NWW6 199 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 CTSFQ9UBX1 484 aa25.34■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 ZFHX4Q86UP3 3567 aa25.33■■□□□ 1.65
CRIP1-201ENST00000330233 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MANBAO00462 879 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CRCPO75575 148 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SASH3O75995 380 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PDYNP01213 254 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TSFMP43897 325 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RAP1GDS1P52306 607 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RPS18P62269 152 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RCN2Q14257 317 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 AP5B1Q2VPB7 878 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SGO1Q5FBB7 561 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RNF175Q8N4F7 328 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 QRFPRQ96P65 431 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SERINC2Q96SA4 455 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM7Q9NQW5 492 aa25.33■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 WDR91A4D1P6 747 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 C4orf51C9J302 202 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CHST10O43529 356 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 B3GALT2O43825 422 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 B3GALT4O96024 378 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 NEFHP12036 1026 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 HSD3B1P14060 373 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 HSD3B2P26439 372 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CCR10P46092 362 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MTTPP55157 894 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CXADRP78310 365 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ERV3-1Q14264 604 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 UGT8Q16880 541 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SYT16Q17RD7 645 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TTMPQ5BVD1 217 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 VWA2Q5GFL6 755 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 UBE3DQ7Z6J8 389 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 OR6Y1Q8NGX8 325 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 NACC2Q96BF6 587 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SPSB2Q99619 263 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 AHSPQ9NZD4 102 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.32■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 USP24Q9UPU5 2620 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 NKX2-8O15522 239 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SH3BGRLO75368 114 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 BMP10O95393 424 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 UROSP10746 265 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 XCR1P46094 333 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 OR4C11Q6IEV9 310 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CUZD1Q86UP6 607 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 OR1F2PQ96R84 312 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TIMM22Q9Y584 194 aa25.31■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0G2JN53 185 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SERTM1A2A2V5 107 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SEMA3DO95025 777 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 IGHEP01854 428 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINE1P05121 402 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 GRK2P25098 689 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 KLC1Q07866 573 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 OR5T3Q8NGG3 340 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 IP6K3Q96PC2 410 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SEMA3GQ9NS98 782 aa25.3■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SAP18O00422 153 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 FGF4P08620 206 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RNH1P13489 461 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 SSR2P43308 183 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 WDR4P57081 412 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CHI3L2Q15782 390 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 RAB43Q86YS6 212 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 THAP4Q8WY91 577 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PEX11GQ96HA9 241 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 CATSPER2Q96P56 530 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA7Q96RP8 456 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.29■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 NUP210LQ5VU65 1888 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM114B3SHH9 223 aa25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CRIP1-201ENST00000330233 PLPP1O14494 284 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms