RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 SERTM1A2A2V5 107 aa24.23■■□□□ 1.47
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SENP3-201ENST00000321337 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 OR56A5P0C7T3 313 aa24.23■■□□□ 1.47
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SENP3-201ENST00000321337 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.22■■□□□ 1.47
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SENP3-201ENST00000321337 TRIM60Q495X7 471 aa24.21■■□□□ 1.47
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SENP3-201ENST00000321337 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.2■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.2■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 C3orf14Q9HBI5 128 aa24.2■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 RAB23Q9ULC3 237 aa24.2■■□□□ 1.47
SENP3-201ENST00000321337 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa24.2■■□□□ 1.47
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