RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 FAM227AF5H4B4 570 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 BIRC5O15392 142 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CHST10O43529 356 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 UMODP07911 640 aa8.6□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 PTPN4P29074 926 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HMOX2P30519 316 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HMGCS1Q01581 520 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 IFT88Q13099 833 aa8.6□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 HERC3Q15034 1050 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HHATQ5VTY9 493 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD13Q7L211 337 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PEX11GQ96HA9 241 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ACPTQ9BZG2 426 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TCFL5Q9UL49 500 aa8.6□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CACNA1BQ00975 2339 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 C21orf140B9A014 251 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 C9J4A7 227 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 H0YIG0 161 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 H3BQF6 201 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MASP2O00187 686 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 NPHS1O60500 1241 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 BMP10O95393 424 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINE1P05121 402 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PRKAR1AP10644 381 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 BSGP35613 385 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 XCR1P46094 333 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 AVPR1BP47901 424 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SLC18A1P54219 525 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 KLC1Q07866 573 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 BST1Q10588 318 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 REPS1Q96D71 796 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SORT1Q99523 831 aa8.59□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa8.59□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 ULK1O75385 1050 aa8.59□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CHSY3Q70JA7 882 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.59□□□□□ -1.03
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PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 FKBP10Q96AY3 582 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 FAR2Q96K12 515 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 KCNC2Q96PR1 638 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 CSF3RQ99062 836 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 GPR87Q9BY21 358 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SLC29A3Q9BZD2 475 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 SLC26A1Q9H2B4 701 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.59□□□□□ -1.03
PDE4D-201ENST00000309641 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PDE4D-201ENST00000309641 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.58□□□□□ -1.04
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