RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 FRMPD2BQ6IN97 320 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 RNF165Q6ZSG1 346 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 METTL4Q8N3J2 472 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 FBXO30Q8TB52 745 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 TSPEARQ8WU66 669 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 GBP5Q96PP8 586 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 OR2A14Q96R47 310 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 SH3GL1Q99961 368 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 SNX8Q9Y5X2 465 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 K7ESF4 209 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 TLR4O00206 839 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 C8orf89P0DMQ9 161 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 CD27P26842 260 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 BSGP35613 385 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 RPS26P62854 115 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 HBA1P69905 142 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 HHEXQ03014 270 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 PCDH1Q08174 1060 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 LAPTM5Q13571 262 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 BLMHQ13867 455 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 TAF11Q15544 211 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 MTX3Q5HYI7 312 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ICA1LQ8NDH6 482 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 OR2T12Q8NG77 320 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 NCLNQ969V3 563 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ITCHQ96J02 903 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 MAGED4Q96JG8 741 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 AP4S1Q9Y587 144 aa10.47□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 CACNA1EQ15878 2313 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 LRP4O75096 1905 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 LRIT2A6NDA9 550 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 C10orf142B7Z368 130 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 ZW10O43264 779 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 CERS1P27544 350 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 HSD17B2P37059 387 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 VHLP40337 213 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 PIK3CBP42338 1070 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 SSR2P43308 183 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 HYAL2Q12891 473 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 BNIP3Q12983 259 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 NRF1Q16656 503 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 RUNDC3AQ59EK9 446 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 COQ5Q5HYK3 327 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 NKAIN2Q5VXU1 208 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 PQLC1Q8N2U9 271 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 JADE3Q92613 823 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 TESCQ96BS2 214 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 FCRL1Q96LA6 429 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 PELI2Q9HAT8 420 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 EML5Q05BV3 1969 aa10.46□□□□□ -0.73
GGPS1-201ENST00000282841 P2RX6O15547 441 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HSD3B1P14060 373 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HSD17B1P14061 328 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CKMT2P17540 419 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HSD3B2P26439 372 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 CMPK1P30085 196 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SHMT2P34897 504 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 HOXD12P35452 270 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 AQP4P55087 323 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 RHDQ02161 417 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZIC1Q15915 447 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SMU1Q2TAY7 513 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 COX20Q5RI15 118 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PRSS41Q7RTY9 318 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SZRD1Q7Z422 152 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 GJD3Q8N144 294 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.744e-13■□□□□ 10.9
GGPS1-201ENST00000282841 PPCDCQ96CD2 204 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 KCNH6Q9H252 994 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 SLAMF7Q9NQ25 335 aa10.46□□□□□ -0.74
GGPS1-201ENST00000282841 ACTR10Q9NZ32 417 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms