RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 NMBRP28336 390 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAN2A2P49641 1150 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ASCL1P50553 236 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CLCN7P51798 805 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 HSPB2Q16082 182 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 IL20RBQ6UXL0 311 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 GK5Q6ZS86 529 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 NAXEQ8NCW5 288 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SARAFQ96BY9 339 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 HPF1Q9NWY4 346 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZFATQ9P243 1243 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CUBNO60494 3623 aa11.49□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PPR1 153 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 E5RI56 91 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 DVL2O14641 736 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 NDUFS4O43181 175 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARHGEF9O43307 516 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZBTB14O43829 449 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP6AP2O75787 350 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 VAPBO95292 243 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TPM3P06753 285 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 APRTP07741 180 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 GABRA1P14867 456 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CNR1P21554 472 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 FDFT1P37268 417 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 GPR143P51810 404 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 FOXO1Q12778 655 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CUL1Q13616 776 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC10A1Q14973 349 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TERF2Q15554 542 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q5PR19 223 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRELID2Q8N945 189 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SIMC1Q8NDZ2 872 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ASB15Q8WXK1 588 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 LRRC46Q96FV0 321 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 VMP1Q96GC9 406 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TCF12Q99081 682 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 LDAHQ9H6V9 325 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 HIVEP2P31629 2446 aa11.48□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CLCA1A8K7I4 914 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 DYNC1I1O14576 645 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CEP104O60308 925 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZFAND5O76080 213 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TPM1P09493 284 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDH1P12830 882 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 GRK3P35626 688 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SOX3P41225 446 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SKP1P63208 163 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPP2R2BQ00005 443 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PWP1Q13610 501 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 C17orf64Q86WR6 236 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC01560Q8TB33 94 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 NCLNQ969V3 563 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MFSD3Q96ES6 412 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 RASL10BQ96S79 203 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MYOTQ9UBF9 498 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 MED16Q9Y2X0 877 aa11.47□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 WWP2O00308 870 aa11.46□□□□□ -0.57
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms