RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 LRRC72A6NJI9 287 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 KLK8O60259 260 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 PHEXP78562 749 aa8.7□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.7□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 FAM20BO75063 409 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 CEP44Q9C0F1 390 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 CTSEP14091 401 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 MAPK1P28482 360 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 CTBSQ01459 385 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 C16orf78Q8WTQ4 265 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.69□□□□□ -1.02
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CKAP2-201ENST00000258607 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 PLXNA3P51805 1871 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 OR6C74A6NCV1 312 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 AQP12BA6NM10 295 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 PLPP1O14494 284 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 BCKDKO14874 412 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 SOX30O94993 753 aa8.69□□□□□ -1.02
CKAP2-201ENST00000258607 RB1P06400 928 aa8.69□□□□□ -1.02
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