RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF778Q96MU6 729 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 CCL19Q99731 98 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.21■□□□□ 0.03
SPCS1-201ENST00000233025 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KIF5CO60282 957 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CCNDBP1O95273 360 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FHP07954 510 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GRIA1P42261 906 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SSR4P51571 173 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 WNT3P56703 355 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CDH17Q12864 832 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GK5Q6ZS86 529 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00523Q86TU6 105 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 DACH2Q96NX9 599 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GSX2Q9BZM3 304 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MED12LQ86YW9 2145 aa15.2■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 G3V3Y1 287 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LIASO43766 372 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HCN1O60741 890 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FOXO1Q12778 655 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KIF5AQ12840 1032 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA3AQ14563 771 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ADCK2Q7Z695 626 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4X1Q8N118 509 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 OR9A1PQ8NGU1 263 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 JKAMPQ9P055 326 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.19■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 A8MVJ9 347 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6AP2O75787 350 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FDFT1P37268 417 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CLCN2P51788 898 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PRUNE1Q86TP1 453 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KCT2Q8NC54 265 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 LDAHQ9H6V9 325 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 HPF1Q9NWY4 346 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MED12Q93074 2177 aa15.18■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MYO1CO00159 1063 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SOX30O94993 753 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 OR6B1O95007 311 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MATN4O95460 622 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TIMP3P35625 211 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PTH2RP49190 550 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ABATP80404 500 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP19Q14CB8 494 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TM4SF19Q96DZ7 209 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 FOPNLQ96NB1 174 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TTC1Q99614 292 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.17■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SH3D21A4FU49 640 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 H7BY64 318 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 SIAH2O43255 324 aa15.16■□□□□ 0.02
SPCS1-201ENST00000233025 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms