RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020753.3

Clhc1-201, Transcript of Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clhc1, Length 2,200 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Slamf6Q9ET39 351 aa3.4□□□□□ -1.86
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Pard6aQ9Z101 346 aa3.4□□□□□ -1.86
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Pck1Q9Z2V4 622 aa3.4□□□□□ -1.86
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
Clhc1-201ENSMUST00000020753 PtprmP28828 1452 aa3.4□□□□□ -1.86
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Casp12O08736 419 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Tpd52l1O54818 204 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Psma3O70435 255 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Stam2O88811 523 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 SmcpP15265 143 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ighv3-6P18531 116 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 RbpjP31266 526 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 ThpoP40226 356 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 FaslgP41047 279 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 E2f2P56931 443 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Fam228bQ497Q6 232 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Snap91Q61548 901 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Six2Q62232 296 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Dcaf13Q6PAC3 445 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Herc4Q6PAV2 1057 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Lrit2Q6PFC5 549 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Mppe1Q80XL7 396 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ttc7aQ8BGB2 858 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Msantd1Q8BIL2 278 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Teddm1bQ8CC62 306 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Alkbh3Q8K1E6 286 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Fmo2Q8K2I3 535 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 SccpdhQ8R127 429 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ppp1r8Q8R3G1 351 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Agr3Q8R3W7 165 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Olfr1Q8VGI1 314 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Olfr48Q8VGN4 301 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Taar1Q923Y8 332 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Hddc3Q9D114 179 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ccdc91Q9D8L5 442 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Adgrl1Q80TR1 1466 aa3.4□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Lipo2D3YY49 398 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 GifP52787 417 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Pms2P54279 859 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Slc12a3P59158 1002 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ces2fQ08ED5 561 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Six3Q62233 333 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Fcrl5Q68SN8 596 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Gpr173Q6PI62 373 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Vmn2r81Q80Z09 865 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 P2ry10Q8BFU7 328 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 PxkQ8BX57 582 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Q8C3M9 231 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Vmn1r203Q8R273 311 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Plcd1Q8R3B1 756 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ankrd49Q8VE42 238 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Atp5g1Q9CR84 136 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Utp23Q9CX11 249 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Lingo1Q9D1T0 614 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ankrd39Q9D2X0 183 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ubqln5Q9D4I8 510 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Cd274Q9EP73 290 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 V1ra8Q9EQ48 279 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 AllcQ9JHX6 414 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Sorcs1Q9JLC4 1167 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Olfr2Q9QWU6 327 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Clec4aQ9QZ15 238 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 MpdzQ8VBX6 2055 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Shroom3Q9QXN0 1986 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Gm44501A8R0T9 150 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Gm7849D3YX03 116 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ccdc71lE9Q4T4 218 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Herc6F2Z461 1003 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 FpgtG5E8F4 590 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 EdaO54693 391 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Avpr2O88721 371 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Tpst2O88856 376 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Il5raP21183 415 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Il1rnP25085 178 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Lhx4P53776 390 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 NcanP55066 1268 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 PcolceQ61398 468 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 MslnQ61468 625 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Tead4Q62296 427 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 PnocQ64387 187 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Ptk6Q64434 451 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Tpgs2Q66JT5 296 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 ToxQ66JW3 526 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 NanogQ80Z64 305 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Gm4922Q8C0N0 497 aa3.39□□□□□ -1.87
Clhc1-201ENSMUST00000020753 Aqp6Q8C4A0 293 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms