RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620055.4

CCL4L2-215, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4 like 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL4L2, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL4L2-215	ENST00000620055	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PTGER1	P34995	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DCT	P40126	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ME1	P48163	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CDH4	P55283	916 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR1D5	P58170	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ARF5	P84085	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ID2	Q02363	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CDC20	Q12834	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CUL4A	Q13619	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IRF4	Q15306	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PIM3	Q86V86	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DPF1	Q92782	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055		A0A096LPK6	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055		A0A1B0GVL5	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAM170A	A1A519	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	EBAG9	O00559	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	CETN3	O15182	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	DOK2	O60496	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	STX10	O60499	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	PTP4A3	O75365	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	YEATS4	O95619	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	TNF	P01375	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	PCCB	P05166	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC2A3	P11169	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ALOX12	P18054	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	TCN2	P20062	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR1E1	P30953	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ACADSB	P45954	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	GPR12	P47775	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	CENPA	P49450	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	OLR1	P78380	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ENPEP	Q07075	957 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CCL4L2-215	ENST00000620055	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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