RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A11Q8WWX8 675 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 ASB1Q9Y576 335 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 C2CD3Q4AC94 2353 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 SAGE2PA6NJ88 616 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 E9PLN8 166 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM10O14672 748 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 BANF1O75531 89 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 FNTAP49354 379 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 HLCSP50747 726 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 PGGT1BP53609 377 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 CCZ1BP86790 482 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 FGD2Q7Z6J4 655 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC10Q8N2F6 343 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 DMRTA2Q96SC8 542 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 VKORC1Q9BQB6 163 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 NAT9Q9BTE0 207 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A16Q9GZN6 736 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRF-216ENST00000617451 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 GUCA1CO95843 209 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM10L1P0DMW3 83 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 MAOAP21397 527 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA8P53708 1063 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 MSS51Q4VC12 460 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 HECTD2Q5U5R9 776 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD53Q8N9V6 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CERS2Q96G23 380 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM10Q96HG1 83 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SPOCK3Q9BQ16 436 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PRRG2O14669 202 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 HNF4AP41235 474 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 RAB8AP61006 207 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 REEP5Q00765 189 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 HYAL2Q12891 473 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 C3P1Q6ZMU1 363 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 TRPV3Q8NET8 790 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PELI2Q9HAT8 420 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 NECTIN3Q9NQS3 549 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 VWA7Q9Y334 891 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 URADA6NGE7 173 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 FCHO1O14526 889 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PTGER1P34995 402 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R7Q15435 360 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SBSNQ6UWP8 590 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 EID3Q8N140 333 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 GPATCH11Q8N954 259 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ACBD4Q8NC06 268 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 C14orf79Q96F83 325 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ENKD1Q9H0I2 346 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL31Q9H511 634 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ZFATQ9P243 1243 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 IKZF3Q9UKT9 509 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP10-9P60411 292 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 NXPE4Q6UWF7 544 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CEP97Q8IW35 865 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SULF2Q8IWU5 870 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 APCDD1LQ8NCL9 501 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 AIF1LQ9BQI0 150 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 RHBGQ9H310 441 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PPT2Q9UMR5 302 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 DYRK1BQ9Y463 629 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 A8MUA0 341 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 NRDCO43847 1150 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINA6P08185 405 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 MEOX1P50221 254 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 RIPPLY3P57055 190 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R3AQ16821 1122 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 BBS9Q3SYG4 887 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 FAM45BPQ6NSW5 357 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CA13Q8N1Q1 262 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 FAM45AQ8TCE6 357 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 CREB3L4Q8TEY5 395 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 AICDAQ9GZX7 198 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRF-216ENST00000617451 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.28■■□□□ 1.32
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