RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 LILRB2Q8N423 598 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 C2orf72A6NCS6 295 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 H2AFB2P0C5Z0 115 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRNA4P43681 627 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ADGRD1Q6QNK2 874 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FZD1Q9UP38 647 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR45Q9Y484 360 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC19A2O60779 497 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 HLA-DPB1P04440 258 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TACR2P21452 398 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVK-8P63133 956 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GALK2Q01415 458 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF283Q8N7M2 679 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ADM5C9JUS6 153 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SAMD10Q9BYL1 202 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL6Q9H0F7 186 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PPA2Q9H2U2 334 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 EDNRBP24530 442 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GTF2BQ00403 316 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ARSIQ5FYB1 569 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SERTAD4Q9NUC0 356 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RLIMQ9NVW2 624 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 IRF9Q00978 393 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DPYSL2Q16555 572 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 LHX5Q9H2C1 402 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GCM1Q9NP62 436 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIB2Q92519 343 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 VIPR1P32241 457 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX2P48431 317 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CDK3Q00526 305 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 PXKQ7Z7A4 578 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CAMKVQ8NCB2 501 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OR7G2Q8NG99 324 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TMBIM1Q969X1 311 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SDSLQ96GA7 329 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 EPHA6Q9UF33 1036 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 H2BFMP0C1H6 154 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SCRN2Q96FV2 425 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCB8Q9NUT2 735 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF6Q9Y252 685 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM170BA6NMN3 283 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF84P51523 738 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ITPK1Q13572 414 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NOMO1Q15155 1222 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 Q8N402 240 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NEIL3Q8TAT5 605 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2B2Q9GZK3 357 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 A8MXE2 369 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 F8W036 122 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR8U9P0C7N5 309 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 BLOC1S1P78537 153 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC52Q8N7C0 313 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 TUBA1CQ9BQE3 449 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DIRAS1O95057 198 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HTR2BP41595 481 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DYRK1AQ13627 763 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SGCAQ16586 387 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF18BQ86Y91 864 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2AG1Q9H205 316 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB31Q13636 194 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 GLT8D1Q68CQ7 371 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NUDT13Q86X67 352 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCC3O15438 1527 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
PTPRJ-207ENST00000613246 BRCC3P46736 316 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms