RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TMED9Q9BVK6 235 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A4O43246 635 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 VIPP01282 170 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AGXTP21549 392 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF616Q08AN1 781 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TGFBIQ15582 683 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DPYSL2Q16555 572 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PWWP2AQ96N64 755 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RNF24Q9Y225 148 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 YDJCA8MPS7 323 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GABRDO14764 452 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IDSP22304 550 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 K7EQM0 130 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HTR1AP08908 422 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNB2P17787 502 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RHDQ02161 417 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ST3GAL3Q11203 375 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MALLQ13021 153 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GPR142Q7Z601 462 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF366Q8N895 744 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TGM7Q96PF1 710 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAOAP21397 527 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DGKGP49619 791 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ATP4BP51164 291 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF84P51523 738 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RAB8AP61006 207 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LILRB2Q8N423 598 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LRP5LA4QPB2 252 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC72A6NJI9 287 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 E9PAM4 449 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CRYZL1O95825 349 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SGCBQ16585 318 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM234Q8WY98 164 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HEBP1Q9NRV9 189 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PP18 115 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ARGFXA6NJG6 315 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 H7C1Q1 480 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ACTL6BO94805 426 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CDRT1O95170 752 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IL1BP01584 269 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6AP1Q15904 470 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ARSHQ5FYA8 562 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LGI4Q8N135 537 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PKP2Q99959 881 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MROQ9BYG7 248 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CNTN3Q9P232 1028 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SRRDQ9UH36 339 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PEAK1Q9H792 1746 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FLRT2O43155 660 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AHSA1O95433 338 aa6.76□□□□□ -1.33
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