RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 STRA8Q7Z7C7 330 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CD163Q86VB7 1156 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SULF2Q8IWU5 870 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 EID3Q8N140 333 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM57AQ8TBR7 257 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NECTIN3Q9NQS3 549 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1CQ13936 2221 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MUA0 341 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TFECO14948 347 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGS2P35354 604 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HNF4AP41235 474 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SCTRP47872 440 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PGGT1BP53609 377 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB8AP61006 207 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SKP1P63208 163 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYMQ14894 314 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPAL1Q6NVV3 410 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SPNS3Q6ZMD2 512 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD13Q7L211 337 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC10Q8N2F6 343 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM58Q8NG06 486 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NEIL2Q969S2 332 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ3Q9NZJ6 369 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 FCHO1O14526 889 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HS6ST1O60243 411 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TPOP07202 933 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD53Q8N9V6 530 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A11Q8WWX8 675 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A14Q96JA4 679 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TSNARE1Q96NA8 513 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf51C9J302 202 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC175P0C221 793 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PGAM1P18669 254 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 HYAL2Q12891 473 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CMPK2Q5EBM0 449 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D19Q8N5T2 526 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 APCDD1LQ8NCL9 501 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL8Q96CD0 374 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A16Q9GZN6 736 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBGQ9H310 441 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL31Q9H511 634 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX1O43933 1283 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCA1CO95843 209 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 AHSGP02765 367 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBP2P18065 325 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TFEBP19484 476 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 AHRP35869 848 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1S2P56377 157 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 REEP5Q00765 189 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CSHL1Q14406 222 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFATQ9P243 1243 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 IKZF3Q9UKT9 509 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCGO15287 622 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 BANF1O75531 89 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM10L1P0DMW3 83 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 IL2P60568 153 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR85P60893 370 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP1B1Q16678 543 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 MDGA2Q7Z553 956 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTN4Q8IWV2 1026 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CA13Q8N1Q1 262 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RPRMLQ8N4K4 120 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM10Q96HG1 83 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 AICDAQ9GZX7 198 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1DO94832 1006 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52N2Q8NGI0 321 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ATL1Q8WXF7 558 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM54Q9BYV2 358 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PLSCR2Q9NRY7 297 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX2-6A6NCS4 301 aa23.91■■□□□ 1.42
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A27PA6NNH2 459 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms