RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 LHX3Q9UBR4 397 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 IL36AQ9UHA7 158 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 SCML1Q9UN30 329 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 FLNCQ14315 2725 aa7.46□□□□□ -1.21
ATG4D-210ENST00000588972 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 B8ZZF3 427 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 IFNL4K9M1U5 179 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PIGNO95427 931 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 IGSF6O95976 241 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 GSRP00390 522 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 WNT1P04628 370 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 FCGR2AP12318 317 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 C6P13671 934 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CKMT2P17540 419 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 MCM3P25205 808 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CDKN2BP42772 138 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 BLKP51451 505 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PRAMEP78395 509 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 RHAGQ02094 409 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 IL10RBQ08334 325 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SLC10A7Q0GE19 358 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CNTN1Q12860 1018 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 RPE65Q16518 533 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ODF2Q5BJF6 829 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ATG9BQ674R7 924 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM65Q6PI78 240 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 MOB3CQ70IA8 216 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 MRGPREQ86SM8 312 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 HAUS1Q96CS2 278 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC114Q96M63 670 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 RNF157Q96PX1 679 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 DONSONQ9NYP3 566 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 DHDHQ9UQ10 334 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 RELNP78509 3460 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PR77 199 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC151A5D8V7 595 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 A8MZ25 164 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ALOX15BO15296 676 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ADAM20O43506 726 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 HLA-DQA2P01906 255 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2B4P06133 528 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC175P0C221 793 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ACP1P24666 158 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 CTNNA2P26232 953 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 IDUAP35475 653 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 MAXP61244 160 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF235Q14590 738 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 TAZQ16635 292 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 MYLK3Q32MK0 819 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 RANBP10Q6VN20 620 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PEX26Q7Z412 305 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PGBD5Q8N414 524 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SERAC1Q96JX3 654 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 BDH2Q9BUT1 245 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4D-210ENST00000588972 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms