RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 THRAP10827 490 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ITIH1P19827 911 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ETV5P41161 510 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC1A6P48664 564 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 GYS2P54840 703 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 MLLT10P55197 1068 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 NAA20P61599 178 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CSNK1G2P78368 415 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 GUCY1A3Q02108 690 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 BST1Q10588 318 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 LCP2Q13094 533 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAF3Q13114 568 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SQSTM1Q13501 440 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PWP1Q13610 501 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 DOC2AQ14183 400 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 KCNAB1Q14722 419 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ZIC1Q15915 447 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ATG9BQ674R7 924 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ATG16L1Q676U5 607 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 FCRL6Q6DN72 434 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PRSS42Q7Z5A4 293 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SYVN1Q86TM6 617 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PAQR7Q86WK9 346 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM129CQ86XR2 697 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 DTX1Q86Y01 620 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 WDR48Q8TAF3 677 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 AGR3Q8TD06 166 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CNDP1Q96KN2 507 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF382Q96SR6 550 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CD180Q99467 661 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SNX7Q9UNH6 387 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 F8P00451 2351 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A0J9YVX5 310 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A1B0GTL3 188 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 OR1F1O43749 312 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SEMA7AO75326 666 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CLDN9O95484 217 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 MLYCDO95822 493 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 JMJD7P0C870 316 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 EBLN1P0CF75 366 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PCNAP12004 261 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CD22P20273 847 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 HRH2P25021 359 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CXCR2P25025 360 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 GRK2P25098 689 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 HMOX2P30519 316 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ARRB2P32121 409 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 GRK3P35626 688 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PKNOX1P55347 436 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 REEP5Q00765 189 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 NAA25Q14CX7 972 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SGO1Q5FBB7 561 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 GRHL2Q6ISB3 625 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF425Q6IV72 752 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CUZD1Q86UP6 607 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 KRT78Q8N1N4 520 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-218ENST00000587547 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms