RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 C8GP07360 202 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ANXA5P08758 320 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 OR56A5P0C7T3 313 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00032P0C843 101 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ZCCHC18P0CG32 403 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PRPS2P11908 318 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 IL1RNP18510 177 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ATF6P18850 670 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 KCNA5P22460 613 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 JAK1P23458 1154 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GATA3P23771 443 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 HMOX2P30519 316 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GGT5P36269 586 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 NNMTP40261 264 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 CCR10P46092 362 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GNPDA1P46926 289 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RXRGP48443 463 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SLC7A2P52569 658 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 CDH13P55290 713 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 POLE2P56282 527 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 AP1S2P56377 157 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PROK1P58294 105 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 NXPH1P58417 271 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SLC7A9P82251 487 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC74AQ0VAA2 488 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 TWF1Q12792 350 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GTF2H2Q13888 395 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RCAN2Q14206 197 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 TGFBIQ15582 683 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 OR4D1Q15615 310 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RBBP7Q16576 425 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 INAVAQ3KP66 663 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 KCTD21Q4G0X4 260 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 XKR7Q5GH72 579 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RNF220Q5VTB9 566 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 USP45Q70EL2 814 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PDPRQ8NCN5 879 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 TSPAN14Q8NG11 270 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 FIBINQ8TAL6 211 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 ATL1Q8WXF7 558 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RAB24Q969Q5 203 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 VPS33AQ96AX1 596 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 LINGO1Q96FE5 620 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SCRN2Q96FV2 425 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-215ENST00000583289 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 P2RY12Q9H244 342 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 HIPK3Q9H422 1215 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ASB8Q9H765 288 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 RMND5AQ9H871 391 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 ASIC5Q9NY37 505 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PTTG2Q9NZH5 202 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 GALPQ9UBC7 116 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 OPTCQ9UBM4 332 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-215ENST00000583289 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.39□□□□□ -1.71
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