RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCN2AQ99250 2005 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL21O00585 134 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDC80O14777 642 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR47O94967 919 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 STSP08842 583 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAOAP21397 527 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 JAK1P23458 1154 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GMPRP36959 345 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD96P40200 585 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDF5P43026 501 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCTRP47872 440 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGTR2P50052 363 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC26A5P58743 744 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R39P59534 338 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R50P59544 299 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP2B1P63010 937 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTG2P78543 158 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf54Q08AI8 447 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1C1Q15619 314 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEP97Q8IW35 865 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MDS2Q8NDY4 140 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATL1Q8WXF7 558 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXT2Q93063 718 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1F2PQ96R84 312 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRT12Q99456 494 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LPAR4Q99677 370 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF32Q9H0A6 362 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL31Q9H511 634 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PELI2Q9HAT8 420 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 COPG2Q9UBF2 871 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF14Q9UBS8 474 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TINAGQ9UJW2 476 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX24Q9Y343 169 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNA1DQ01668 2161 aa6.74□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GUH1 482 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRF1P14222 555 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNFRSF8P28908 595 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RFC3P40938 356 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC12A2P55011 1212 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SKP1P63208 163 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSF1Q00613 529 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PWP1Q13610 501 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXT1Q16394 746 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 C3AR1Q16581 482 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEP1AQ16819 746 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINK14Q6IE38 97 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD13Q7L211 337 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GALNT7Q86SF2 657 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CREG2Q8IUH2 290 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC5A8Q8N695 610 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX31Q8N9S9 440 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM47BQ8NA70 645 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 M1APQ8TC57 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NT5CQ8TCD5 201 aa6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms