RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	METTL6	Q8TCB7	284 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CCT6B	Q92526	530 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	NCSTN	Q92542	709 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	IL17F	Q96PD4	163 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TGM7	Q96PF1	710 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SERPINI1	Q99574	410 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CMKLR1	Q99788	373 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	DPH7	Q9BTV6	452 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	XKR8	Q9H6D3	395 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CEP250	Q9BV73	2442 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	WDR91	A4D1P6	747 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	BLACE	A4D250	179 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	GMNC	A6NCL1	334 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	RGS14	O43566	566 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	RASSF9	O75901	435 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CAPN1	P07384	714 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CD63	P08962	238 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TYRP1	P17643	537 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	MAG	P20916	626 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CD82	P27701	267 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PSMB5	P28074	263 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CSF2RB	P32927	897 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	LSP1	P33241	339 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CDH13	P55290	713 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CCL7	P80098	99 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	CFHR1	Q03591	330 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	GRM7	Q14831	915 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	HERC3	Q15034	1050 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	NDUFA9	Q16795	377 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	AMZ1	Q400G9	498 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SPIN4	Q56A73	249 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	FCRL6	Q6DN72	434 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ABHD13	Q7L211	337 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ADCK2	Q7Z695	626 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SYVN1	Q86TM6	617 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	GPR135	Q8IZ08	494 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	LSMEM2	Q8N112	164 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	OR7G3	Q8NG95	312 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	NT5C	Q8TCD5	201 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ESAM	Q96AP7	390 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	QRFPR	Q96P65	431 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53

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