RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 MAL2Q969L2 176 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 DMTF1Q9Y222 760 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 SPTBP11277 2137 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 A6NCN8 305 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 LRIT2A6NDA9 550 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 METTL12A8MUP2 240 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 KLHL18O94889 574 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 C9P02748 559 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 NUDT7P0C024 238 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 BCKDHBP21953 392 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 HTR1EP28566 365 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CD38P28907 300 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CRATP43155 626 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 HHEXQ03014 270 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 GAB1Q13480 694 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 LCN8Q6JVE9 175 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 LMX1AQ8TE12 382 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 FCRL1Q96LA6 429 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 LRRC61Q9BV99 259 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 AQP12BA6NM10 295 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PDLIM1O00151 329 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PRMT3O60678 531 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 FURINP09958 794 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ACPPP15309 386 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 GCKP35557 465 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 BSGP35613 385 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CXCL12P48061 93 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 DMWDQ09019 674 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 HSPB3Q12988 150 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 MPEG1Q2M385 716 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 AQP12AQ8IXF9 295 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PJA1Q8NG27 643 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 RGMAQ96B86 450 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 MAGED4Q96JG8 741 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 NELL2Q99435 816 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 RHBGQ9H310 441 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 LHX9Q9NQ69 397 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 MCM8Q9UJA3 840 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 VPS4AQ9UN37 437 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CXCR6O00574 342 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZNF682O95780 498 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ALPPL2P10696 532 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 UGT2B7P16662 529 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CD27P26842 260 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 BLKP51451 505 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 NUDT13Q86X67 352 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.123e-30■■■■■ 35.2
CS-215ENST00000549143 NETO1Q8TDF5 533 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 STARD8Q92502 1023 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CS-215ENST00000549143 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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