RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	MALT1	Q9UDY8	824 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ITM2B	Q9Y287	266 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NCAPD2	Q15021	1401 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A087X0K7	114 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPI3	338 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CD8B2	A6NJW9	211 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	C17orf105	B2RV13	164 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF103	O00237	685 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNGR3	O43761	229 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CTSV	O60911	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD51D	O75771	328 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	BBOX1	O75936	387 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SP9	P0CG40	484 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNA2	P20248	432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	IL10	P22301	178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SSTR1	P30872	391 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	IL10RB	Q08334	325 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF5A	Q12840	1032 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SNTA1	Q13424	505 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE7A	Q13946	482 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LTBP1	Q14766	1721 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR2DS3	Q14952	304 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RBBP7	Q16576	425 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PHKG1	Q16816	387 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	XKR3	Q5GH77	459 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ANO5	Q75V66	913 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	EID3	Q8N140	333 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2T12	Q8NG77	320 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PGM2	Q96G03	612 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF560	Q96MR9	790 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K3	Q99759	626 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CUEDC2	Q9H467	287 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	EBF2	Q9HAK2	575 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	HPF1	Q9NWY4	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TJP1	Q07157	1748 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TLR4	O00206	839 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TXNL1	O43396	289 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ACSL4	O60488	711 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ALPL	P05186	524 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	F3	P13726	295 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NR1D1	P20393	614 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MSH3	P20585	1137 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CA4	P22748	312 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHA2	P29317	976 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	THBS3	P49746	956 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	CDH11	P55287	796 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	EVC	P57679	992 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KLC1	Q07866	573 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	LGALS3BP	Q08380	585 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK11	Q15759	364 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	PLD3	Q8IV08	490 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	TDH	Q8IZJ6	230 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ELP5	Q8TE02	316 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81

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