RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504292.1

ABCE1-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 3

Gene ABCE1, Length 625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-204	ENST00000504292	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	OBSL1	O75147	1896 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CTSV	O60911	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	EDN1	P05305	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KRT19	P08727	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MAGEA11	P43364	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CDH8	P55286	799 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	EVC	P57679	992 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC7A9	P82251	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ILK	Q13418	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	OLIG2	Q13516	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PDIA5	Q14554	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	GANC	Q8TET4	914 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MYH10	P35580	1976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ANK1	P16157	1881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292		A0A1B0GU03	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292		K7ENM7	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292		M0QZ24	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PIR	O00625	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	KCNN4	O15554	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	DNTT	P04053	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	GP1BB	P13224	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	IL7R	P16871	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CKMT2	P17540	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	MAPK9	P45984	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TPMT	P51580	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	COG7	P83436	770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	STPG4	Q8N801	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	GABRG3	Q99928	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCE1-204	ENST00000504292	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292	KALRN	O60229	2985 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCE1-204	ENST00000504292		A0A1W2PP11	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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