RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 ZNF30P17039 623 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TRPC1P48995 793 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CLDN8P56748 225 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 NDUFA5Q16718 116 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TRAM1L1Q8N609 369 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 GANCQ8TET4 914 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 YIPF6Q96EC8 236 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 VNN3Q9NY84 501 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PBX2P40425 430 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ZNF234Q14588 700 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SYT16Q17RD7 645 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PRSS36Q5K4E3 855 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SZRD1Q7Z422 152 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PJA1Q8NG27 643 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 OR7G3Q8NG95 312 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 NUS1Q96E22 293 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 EVPLLA8MZ36 301 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 LCKP06239 509 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 JUPP14923 745 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PSMB5P28074 263 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 DCTP40126 519 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.153e-8■■■■□ 20.8
PFKL-211ENST00000498841 FXNQ16595 210 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 FGF13Q92913 245 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 PPIL1Q9Y3C6 166 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 OR1A2Q9Y585 309 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 LTBP2Q14767 1821 aa16.01■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ST13P50502 369 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CAMK2BQ13554 666 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ADCK2Q7Z695 626 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 EID3Q8N140 333 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 OR8J3Q8NGG0 315 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ATL1Q8WXF7 558 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SPINT1O43278 529 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 GSTM1P09488 218 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CD36P16671 472 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SOAT1P35610 550 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CASP3P42574 277 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CNTN1Q12860 1018 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 NELL1Q92832 810 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CHFRQ96EP1 664 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CMTM7Q96FZ5 175 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 RDH12Q96NR8 316 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 LGR4Q9BXB1 951 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TRIM39Q9HCM9 518 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 TESMINQ9Y4I5 508 aa16■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ADH1CP00326 375 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CRATP43155 626 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ALDH9A1P49189 494 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 HNMTP50135 292 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 EPS8Q12929 822 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 OR52J3Q8NH60 311 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 WDR48Q8TAF3 677 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 KXD1Q9BQD3 176 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 RASSF1Q9NS23 344 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 DYRK3O43781 588 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 ALOX12P18054 663 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 IL12RB1P42701 662 aa15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PFKL-211ENST00000498841 GPM6BQ13491 265 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms