RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF141	Q8WVD5	230 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LPAR4	Q99677	370 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXC2	Q99958	501 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB1	Q9Y576	335 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GTH9	108 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF839	A8K0R7	811 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511		E7EVH7	732 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YIG0	161 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BS24	57 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFS3	O75489	264 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	STATH	P02808	62 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CYC1	P08574	325 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA1	P43355	309 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB561	P49447	251 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TTPA	P49638	278 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EFNA3	P52797	238 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM53B	Q14153	422 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CEBPE	Q15744	281 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SFT2D3	Q587I9	215 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NINJ1	Q92982	152 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OLFM1	Q99784	485 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP25	Q9NPA2	562 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2W5	A6NFC9	320 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS13	O14921	159 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CBFA2T2	O43439	604 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NME2P1	O60361	137 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NEURL1	O76050	574 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFBP2	P18065	325 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1RN	P18510	177 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	DNASE1	P24855	282 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRA1D	P25100	572 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA3	P25788	255 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RWDD2B	P57060	319 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA3A	Q14563	771 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	NSDHL	Q15738	373 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ICE2	Q659A1	982 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF534	Q76KX8	674 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PLD3	Q8IV08	490 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2A5	Q96R48	311 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPN	Q9BXN1	380 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	SGK494	L7N484	410 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HAT1	O14929	419 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RX6	O15547	441 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	HS6ST1	O60243	411 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	MFAP3L	O75121	409 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE9A	O76083	593 aa		10.15	□□□□□ -0.78

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