RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CCT6B	Q92526	530 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	HAS2	Q92819	552 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TSLP	Q969D9	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RHBG	Q9H310	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.14	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PRAMEF4	O60810	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SEMA7A	O75326	666 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	WDPCP	O95876	746 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	GSTM2	P28161	218 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PHB	P35232	272 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	OR4D2	P58180	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BTN3A2	P78410	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	DOC2A	Q14183	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	EXT1	Q16394	746 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MNS1	Q8NEH6	495 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	GRHL3	Q8TE85	626 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FAR2	Q96K12	515 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	LPAR4	Q99677	370 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	COPG2	Q9UBF2	871 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ASB1	Q9Y576	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		A0A087X1B8	175 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332		A0A0G2JN53	185 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	HMX2	A2RU54	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BLACE	A4D250	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	UBXN8	O00124	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	PRMT3	O60678	531 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	KERA	O60938	352 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	SUPT3H	O75486	399 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CLEC3A	O75596	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	C2	P06681	752 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	CTAGE8	P0CG41	777 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	EPOR	P19235	508 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	BTG2	P78543	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	IRF9	Q00978	393 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	IRF8	Q02556	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.12	□□□□□ -0.63
THBS3-208	ENST00000496332	RELL1	Q8IUW5	271 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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