RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.71□□□□□ -0.53
SUCLG2-204ENST00000493112 CD274Q9NZQ7 290 aa11.71□□□□□ -0.53
SUCLG2-204ENST00000493112 RNF112Q9ULX5 631 aa11.71□□□□□ -0.53
SUCLG2-204ENST00000493112 ASB1Q9Y576 335 aa11.71□□□□□ -0.53
SUCLG2-204ENST00000493112 A0A0G2JN53 185 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 URADA6NGE7 173 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 A8MUI8 341 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 MAGEB17A8MXT2 336 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SERPINA6P08185 405 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 JAK1P23458 1154 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 GGT5P36269 586 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 AP2B1P63010 937 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 NAB1Q13506 487 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 RAPH1Q70E73 1250 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SNX31Q8N9S9 440 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CCT6BQ92526 530 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 RHBGQ9H310 441 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ALG9Q9H6U8 611 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 STK16O75716 305 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 GP1BBP13224 206 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 EPORP19235 508 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 TFEBP19484 476 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CD22P20273 847 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 KCNC1P48547 511 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 OR4D2P58180 307 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 BTG2P78543 158 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 PDK4Q16654 411 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 BEST3Q8N1M1 668 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 KRT78Q8N1N4 520 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CA13Q8N1Q1 262 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF592Q92610 1267 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 HAS2Q92819 552 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SMIM10Q96HG1 83 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 LPAR4Q99677 370 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 NPAS2Q99743 824 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 RNF32Q9H0A6 362 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 KCNK13Q9HB14 408 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 COPG2Q9UBF2 871 aa11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 POLEQ07864 2286 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 OR5H15A6NDH6 313 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM227AF5H4B4 570 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 UBXN8O00124 270 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CLGNO14967 610 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 MAN1A2O60476 641 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SUPT3HO75486 399 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 MAOAP21397 527 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC26A5P58743 744 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 BTN3A2P78410 334 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 IRF9Q00978 393 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 DOC2AQ14183 400 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 EXT1Q16394 746 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 XKR6Q5GH73 641 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 TTLQ8NG68 377 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 M1APQ8TC57 530 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 FAR1Q8WVX9 515 aa11.69□□□□□ -0.54
SUCLG2-204ENST00000493112 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms