RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPRED1Q7Z699 444 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPACA7Q96KW9 195 aa6.74□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VPS4AQ9UN37 437 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRR19A6NJB7 356 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MMP20O60882 483 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF682O95780 498 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA1P01009 418 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 APODP05090 189 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RAP2AP10114 183 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CD82P27701 267 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CTSKP43235 329 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IL1RL1Q01638 556 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VAC14Q08AM6 782 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC36A3Q495N2 470 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPATS1Q496A3 300 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C2orf27AQ580R0 203 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MICU2Q8IYU8 434 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TERB1Q8NA31 727 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR4K3Q96R72 315 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PANX1Q96RD7 426 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HAUS8Q9BT25 410 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SERHLQ9NQF3 203 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 WNT9AO14904 365 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KPNA5O15131 536 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FLRT2O43155 660 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CREG1O75629 220 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DIRAS1O95057 198 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ETHE1O95571 254 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CRYZL1O95825 349 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ADH1BP00325 375 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EGFP01133 1207 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CATP04040 527 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 MPC1LP0DKB6 136 aa6.73□□□□□ -1.33
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF12P17014 697 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AMD1P17707 334 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MMP12P39900 470 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CAPGP40121 348 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KIR3DL1P43629 444 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AP1S2P56377 157 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GBX1Q14549 363 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PON2Q15165 354 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SMU1Q2TAY7 513 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ERAP2Q6P179 960 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MUS81Q96NY9 551 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NRTNQ99748 197 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 H3BM21 787 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 UPK1AO00322 258 aa6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLCO2B1O94956 709 aa6.73□□□□□ -1.33
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