RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 MAP2K2P36507 400 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GALK2Q01415 458 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM7Q14002 265 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 LACC1Q8IV20 430 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TEX26Q8N6G2 289 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 URGCPQ8TCY9 931 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GANCQ8TET4 914 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 HAS2Q92819 552 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CASP10Q92851 521 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WW49 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD3O43242 534 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SYT7O43581 403 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CD48P09326 243 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 BATF2Q8N1L9 274 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA18Q8TC71 538 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK15Q8TD08 544 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 OMA1Q96E52 524 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 LURAP1Q96LR2 239 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 WWOXQ9NZC7 414 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WZ39 114 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS44E7EML9 344 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SLC28A1O00337 649 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1G1O75348 118 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC192P0DO97 292 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ANPEPP15144 967 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 AREGP15514 252 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A6P19224 532 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CYP3A5P20815 502 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 AHCYP23526 432 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 IL1RL1Q01638 556 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TAB1Q15750 504 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ELMOD1Q8N336 334 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 WBP2Q969T9 261 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MAGED4Q96JG8 741 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 F2RL3Q96RI0 385 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PKP2Q99959 881 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PIGQQ9BRB3 760 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf21Q9H246 121 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MARCH7Q9H992 704 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 POMT2Q9UKY4 750 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 KRT87PA6NCN2 255 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CHUKO15111 745 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF432O94892 652 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ALPPP05187 535 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ALPPL2P10696 532 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM1P13688 526 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CEBPBP17676 345 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ITGB6P18564 788 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFB3P59826 476 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GUCY2DQ02846 1103 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GABPAQ06546 454 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GPR50Q13585 617 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GIT2Q14161 759 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 STX1AQ16623 288 aa6.72□□□□□ -1.33
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