RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PTPRDP23468 1912 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CDH23Q9H251 3354 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GPX5O75715 221 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PDGFAP04085 211 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 IL6P05231 212 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RETP07949 1114 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GANABQ14697 944 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYND11Q15326 602 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 STK11Q15831 433 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TXNDC8Q6A555 127 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC37A3Q8NCC5 494 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GALNT11Q8NCW6 608 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 APH1BQ8WW43 257 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEH1Q9H213 219 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RHCGQ9UBD6 479 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 VWA8A3KMH1 1905 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 B4DXG7 233 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CLIC1O00299 241 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 E2F3O00716 465 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CCNDBP1O95273 360 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TNNI3P19429 210 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 UGT8Q16880 541 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CHPFQ8IZ52 775 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PRR35P0CG20 571 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAN2A2P49641 1150 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CDH4P55283 916 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC14A1Q13336 389 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 IL18Q14116 193 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FAM26DQ5JW98 314 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 WFDC5Q8TCV5 224 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MGME1Q9BQP7 344 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RLIMQ9NVW2 624 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC6A14Q9UN76 642 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ALG5Q9Y673 324 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 H3BN98 237 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 KDELR2P33947 212 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RPS14P62263 151 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ARF5P84085 180 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC14A2Q15849 920 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 STK40Q8N2I9 435 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RIT1Q92963 219 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 WACQ9BTA9 647 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MYO10Q9HD67 2058 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SUV39H1O43463 412 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 BCKDHAP12694 445 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SDHBP21912 280 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ACVR2AP27037 513 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FGFBP1Q14512 234 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 OR9Q2Q8NGE9 314 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC115Q96NT0 180 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TRIB3Q96RU7 358 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF382Q96SR6 550 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SSR3Q9UNL2 185 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CMAHPQ9Y471 501 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PDPK1O15530 556 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SH3BP5O60239 455 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV3-27P01718 113 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GPC1P35052 558 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ABATP80404 500 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC66Q68CR7 880 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms