RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 NUP107P57740 925 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CRADDP78560 199 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PWP1Q13610 501 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 GXYLT1Q4G148 440 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CENPUQ71F23 418 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PEX26Q7Z412 305 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ASPGQ86U10 573 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PRELID2Q8N945 189 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 KCNJ9Q92806 393 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 MFSD3Q96ES6 412 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PEX11GQ96HA9 241 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 HES6Q96HZ4 224 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 BFARQ9NZS9 450 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 DHRS7Q9Y394 339 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 A0A1B0GVC2 190 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 OR14I1A6ND48 311 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PROM1O43490 865 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CHST10O43529 356 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZWINTO95229 277 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 IGHG3P01860 377 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 NPPBP16860 134 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ALOX12P18054 663 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 GPR143P51810 404 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PPP2R2AP63151 447 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ADAM8P78325 824 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CDK16Q00536 496 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 MYBPHQ13203 477 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 TERF2Q15554 542 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 NEPROQ6NW34 567 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 C8orf74Q6P047 294 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PAOXQ6QHF9 649 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CES3Q6UWW8 571 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 C4orf22Q6V702 233 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 MDGA2Q7Z553 956 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 FAM136AQ96C01 138 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 SGPP1Q9BX95 441 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 LIME1Q9H400 295 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 RASSF1Q9NS23 344 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 DEPPQ9NTK1 212 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 SOX13Q9UN79 622 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 EDARQ9UNE0 448 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 E5RI56 91 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 CCDC188H7C350 402 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 SYT5O00445 386 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00578-201ENST00000439009 BCKDKO14874 412 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms