RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409289.6

RBMS1-204, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-204ENST00000409289 ST6GAL1P15907 406 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CKMT2P17540 419 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF33BQ06732 778 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 NAA25Q14CX7 972 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 GALNTL6Q49A17 601 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 Q6ZSR9 355 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 OR2T11Q8NH01 316 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 RP1P56715 2156 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 OR2A25A4D2G3 310 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TLCD2A6NGC4 264 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 E9PBE3 544 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 KLHL41O60662 606 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 PRAMEF10O60809 474 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SEC22BO75396 215 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 C9P02748 559 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 HSD3B1P14060 373 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 LBPP18428 481 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TGM1P22735 817 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 HSD3B2P26439 372 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 BCL6P41182 706 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 PIK3CBP42338 1070 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CYP4F2P78329 520 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 HMGCS1Q01581 520 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CFHR1Q03591 330 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CYP4F3Q08477 520 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TUBB3Q13509 450 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 XKR7Q5GH72 579 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 NAXDQ8IW45 347 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TTLQ8NG68 377 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CD180Q99467 661 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ACPTQ9BZG2 426 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 RHBGQ9H310 441 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 OR51B5Q9H339 312 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 BRF2Q9HAW0 419 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.25□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 A0A1W2PQM1 296 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CCDC22O60826 627 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CTSVO60911 334 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CLEC3AO75596 197 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CPNE6O95741 557 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 STATHP02808 62 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 ACP1P24666 158 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 CSF2RBP32927 897 aa8.24□□□□□ -1.09
RBMS1-204ENST00000409289 AHRP35869 848 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms