RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0G2JMM0 328 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PPB8 328 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PRS3 328 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 KIR3DP1A8MWS1 328 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 E5RI56 91 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 GFYI3L273 518 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ACOT7O00154 380 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SYT5O00445 386 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CBFA2T2O43439 604 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 VAPBO95292 243 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 LY6G6DO95868 133 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 IFNB1P01574 187 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 IGHG3P01860 377 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 APRTP07741 180 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 STIP1P31948 543 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CLCN2P51788 898 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CLCN7P51798 805 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CUL1Q13616 776 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 HERC3Q15034 1050 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PRELID2Q8N945 189 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD9Q8NBP5 474 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 GIMAP7Q8NHV1 300 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD3Q96ES6 412 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TTTY12Q9BZ98 90 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 EML6Q6ZMW3 1958 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GVC2 190 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 G3V3Y1 287 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB14O43829 449 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MPC1LP0DKB6 136 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SSR4P51571 173 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ADARP55265 1226 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf185Q5T7R7 199 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MRNIPQ6NTE8 343 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TRILQ7L0X0 811 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CNGA4Q8IV77 575 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 B3GNT7Q8NFL0 401 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA3Q8NHX4 192 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 FAM222BQ8WU58 562 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CNPPD1Q9BV87 410 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ATG10Q9H0Y0 220 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH4Q9NXW9 302 aa17.92■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 GLSO94925 669 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 F7P08709 466 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ALOX12P18054 663 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEA5P43359 124 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 IL20RBQ6UXL0 311 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RGS9BPQ6ZS82 235 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A16Q86VW1 577 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf64Q86WR6 236 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM251Q8N6I4 163 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TCF12Q99081 682 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM9Q9NQV7 894 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ZFATQ9P243 1243 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ACAD8Q9UKU7 415 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 JMJD1CQ15652 2540 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 RTTNQ86VV8 2226 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 A8MVJ9 347 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 AQP7O14520 342 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFS4O43181 175 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 WDR1O75083 606 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 MYO1DO94832 1006 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CELA3AP09093 270 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CDH1P12830 882 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PCSK6P29122 969 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PEX19P40855 299 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SPA17Q15506 151 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 TTLL9Q3SXZ7 439 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 XKR6Q5GH73 641 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 CENPUQ71F23 418 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC57Q8N9N7 239 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 LRRN4CLQ8ND94 238 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SH3GL2Q99962 352 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 SARGQ9BW04 601 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXD12-201ENST00000404162 HPF1Q9NWY4 346 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms