RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 DLK2Q6UY11 383 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF627Q7L945 461 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NINJ1Q92982 152 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 HCN2Q9UL51 889 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NENFQ9UMX5 172 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 USP54Q70EL1 1684 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 DISC1C4P0D8 188 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 PDYNP01213 254 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MT-ND2P03891 347 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 HLA-DPB1P04440 258 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 EPHX1P07099 455 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 HK1P19367 917 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 MATN1P21941 496 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 S100PP25815 95 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 HSD11B1P28845 292 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 RPA4Q13156 261 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 UBXN11Q5T124 520 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 FAM124AQ86V42 546 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 GPR151Q8TDV0 419 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 NRG4Q8WWG1 115 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 ASPNQ9BXN1 380 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 H7C2Y5 167 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHGA12O60330 932 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 COQ9O75208 318 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TBX18O95935 607 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD18Q0P651 414 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NFATC3Q12968 1075 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 XKRXQ6PP77 449 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CHST9Q7L1S5 443 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SACM1LQ9NTJ5 587 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 E7EQ34 232 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SOCS2O14508 198 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PLD2O14939 933 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 IFNA10P01566 189 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HRGP04196 525 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GSTM2P28161 218 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HLCSP50747 726 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PON2Q15165 354 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PON3Q15166 354 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT13Q86X67 352 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NCSTNQ92542 709 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GATA6Q92908 595 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 BIRC8Q96P09 236 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF69Q9UC07 566 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CHD4Q14839 1912 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PQY0 241 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HAS3O00219 553 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TGFB1P01137 390 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CHRNA1P02708 482 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GNAO1P09471 354 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PSMD8P48556 350 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CTBP2P56545 445 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF45Q02386 682 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RELAQ04206 551 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF33AQ06730 810 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 PTPRCAPQ14761 206 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ARSKQ6UWY0 536 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FNIP2Q9P278 1114 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RHCGQ9UBD6 479 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 J3KR12 359 aa8.58□□□□□ -1.04
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