RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 TAS2R50P59544 299 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 SRP54P61011 504 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 ACTR1AP61163 376 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 CSNK1G2P78368 415 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 VEZF1Q14119 521 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 HEPACAMQ14CZ8 416 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 TEAD4Q15561 434 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 NRF1Q16656 503 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM35AQ53FP2 167 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 CPZQ66K79 652 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA0895LQ68EN5 471 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 SYT13Q7L8C5 426 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 WDR48Q8TAF3 677 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 BMFQ96LC9 184 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-202ENST00000395322 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 C1orf226A1L170 272 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 H0Y8X5 98 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 PLPP1O14494 284 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 CLOCKO15516 846 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 GPR37L1O60883 481 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF217O75362 1048 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 RASGRP1O95267 797 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 RASAL1O95294 804 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 IL3P08700 152 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 F3P13726 295 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 DDCP20711 480 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 AHRP35869 848 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 CYP4F2P78329 520 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 FADDQ13158 208 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 BIRC2Q13490 618 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 VMACQ2NL98 169 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF787Q6DD87 383 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 RD3Q7Z3Z2 195 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 SPRED1Q7Z699 444 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 OR2L3Q8NG85 312 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 FBXO30Q8TB52 745 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ZFPM2Q8WW38 1151 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 LCN9Q8WX39 176 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 VPS50Q96JG6 964 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 SARGQ9BW04 601 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 CD93Q9NPY3 652 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D29Q9UFV1 150 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 SNX7Q9UNH6 387 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 BTBD3Q9Y2F9 522 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 V9GYQ6 96 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 REV3LO60673 3130 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 FEZF1A0PJY2 475 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 FAM149AA5PLN7 773 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 SHISA7A6NL88 538 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 C10orf142B7Z368 130 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 GUCY1B2O75343 617 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TNFAIP8O95379 198 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 KRT75O95678 551 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 B3GALT4O96024 378 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINA1P01009 418 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TNFP01375 233 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 GBAP04062 536 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF23P17027 643 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 CKMT2P17540 419 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 BSGP35613 385 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TSFMP43897 325 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TGM3Q08188 693 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 Q6ZSR6 202 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ADHFE1Q8IWW8 467 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 CBR4Q8N4T8 237 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TSTD1Q8NFU3 115 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP90Q8TF47 636 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-202ENST00000395322 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms