RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 ATG13O75143 517 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SH3BGRLO75368 114 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 TNFRSF21O75509 655 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HLA-FP30511 346 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SEPHS1P49903 392 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 NUDT6P53370 316 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF284Q2VY69 593 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CCDC80Q76M96 950 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF558Q96NG5 402 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 OR4K3Q96R72 315 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 EHD1Q9H4M9 534 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ASNA1O43681 348 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SGTAO43765 313 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 GABRB1P18505 474 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HBA1P69905 142 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 DMC1Q14565 340 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SLC35B4Q969S0 331 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 LMLNQ96KR4 655 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PIP5K1AQ99755 562 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CFL2Q9Y281 166 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HAT1O14929 419 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 DSCR3O14972 297 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CCNB2O95067 398 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SLC16A8O95907 504 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 APOA1P02647 267 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HSMCR30P0CW71 290 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 FUT4P22083 530 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 IMPA1P29218 277 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 OR1E2P47887 323 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 UGT2B15P54855 530 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CDK6Q00534 326 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SELENBP1Q13228 472 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 Q6ZVU0 165 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 NLRP8Q86W28 1048 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PPCDCQ96CD2 204 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SCLYQ96I15 445 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 OR51E2Q9H255 320 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 RLIMQ9NVW2 624 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 IFT52Q9Y366 437 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 TSPAN6O43657 245 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SNX4O95219 450 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 KRT75O95678 551 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 C6orf47O95873 294 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PTHP01270 115 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ALOX12P18054 663 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 TNFRSF1BP20333 461 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 BDKRB1P46663 353 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 MVDP53602 400 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 IRF3Q14653 427 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 KCNJ8Q15842 424 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 COX20Q5RI15 118 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 GAREM2Q75VX8 874 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CHST14Q8NCH0 376 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 PKP4Q99569 1192 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 CLN6Q9NWW5 311 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SPG21Q9NZD8 308 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 WASH3PC4AMC7 463 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 LEFTY2O00292 366 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 GPR37L1O60883 481 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 GADD45GO95257 159 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ALDH9A1P49189 494 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 E2F2Q14209 437 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF385BQ569K4 471 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC22-201ENST00000376227 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms