RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 PCDH7O60245 1069 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 THRAP10827 490 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 CERS1P27544 350 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 RAP1GDS1P52306 607 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 HSD11B2P80365 405 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 NHLH1Q02575 133 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 CUL3Q13618 768 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ADPRMQ3LIE5 342 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ABHD17CQ6PCB6 329 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PDSS2Q86YH6 399 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 EPB41L1Q9H4G0 881 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PRDM7Q9NQW5 492 aa19.3■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 BTN3A2P78410 334 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 RPS6KA2Q15349 733 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SPATA19Q7Z5L4 167 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SLITRK4Q8IW52 837 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 DEFB124Q8NES8 71 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 TTLQ8NG68 377 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 OR4D9Q8NGE8 314 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 VPS33AQ96AX1 596 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SLC41A2Q96JW4 573 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 IRAK4Q9NWZ3 460 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 C5AR2Q9P296 337 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ANKMY1Q9P2S6 941 aa19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM150CB9EJG8 249 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SLC35G6P0C7Q6 338 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 NELFEP18615 380 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.685e-7■■□□□ 12.7
TMCO3-201ENST00000375391 ARL4DP49703 201 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 DGKQP52824 942 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PHEXP78562 749 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PRSS53Q2L4Q9 553 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 OR5T3Q8NGG3 340 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 STON2Q8WXE9 905 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 CD180Q99467 661 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 BRINP2Q9C0B6 783 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 OCIAD1Q9NX40 245 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PPT2Q9UMR5 302 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PMS2P1A4D2B8 440 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 NPIPB8E9PQR5 432 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 LRP3O75074 770 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 IDO1P14902 403 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PLIN5Q00G26 463 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF33BQ06732 778 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SQSTM1Q13501 440 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SPIDRQ14159 915 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 C16orf72Q14CZ0 275 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 VPS26BQ4G0F5 336 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 OR4C11Q6IEV9 310 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA2013Q8IYS2 634 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 MIER2Q8N344 545 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 D2HGDHQ8N465 521 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 TBC1D19Q8N5T2 526 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 OR2L5Q8NG80 312 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 OR1L3Q8NH93 324 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 KLHL6Q8WZ60 621 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 APMAPQ9HDC9 416 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SEMA5BQ9P283 1151 aa19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 CROCCQ5TZA2 2017 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 H3BMH7 237 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 FKBP9O95302 570 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SSR2P43308 183 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 TAS2R50P59544 299 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PWP1Q13610 501 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SQLEQ14534 574 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 NAA25Q14CX7 972 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 INAVAQ3KP66 663 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SPIN4Q56A73 249 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PRSS42Q7Z5A4 293 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 SNX32Q86XE0 403 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 MARCH9Q86YJ5 346 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 NT5CQ8TCD5 201 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 RGMAQ96B86 450 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 FCRL1Q96LA6 429 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 PDP2Q9P2J9 529 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 ADGRE2Q9UHX3 823 aa19.27■□□□□ 0.68
TMCO3-201ENST00000375391 LAMA5O15230 3695 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 GLOD5A6NK44 160 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 TIAF1O95411 115 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 DHRS13Q6UX07 377 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 ACOT4Q8N9L9 421 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 PMEPA1Q969W9 287 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 C10orf90Q96M02 699 aa19.27■□□□□ 0.67
TMCO3-201ENST00000375391 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms