RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 WDR20Q8TBZ3 569 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 MAL2Q969L2 176 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SLC46A2Q9BY10 475 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 C14orf119Q9NWQ9 140 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SH3BP4Q9P0V3 963 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ERVW-1Q9UQF0 538 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa12.68□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 MGAT4DA6NG13 374 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 DSCR3O14972 297 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TGM5O43548 720 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 AIREO43918 545 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 APOA1P02647 267 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 DNTTP04053 509 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 PREPP48147 710 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CASP9P55211 416 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CXCR4P61073 352 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RPP38P78345 283 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 FAM214AQ32MH5 1076 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CCSMST1Q4G0I0 132 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 Q5BKY6 102 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM159Q96B96 161 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 LMLNQ96KR4 655 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 FCRL1Q96LA6 429 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CREBZFQ9NS37 354 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NPAP1Q9NZP6 1156 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CCL26Q9Y258 94 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 OBSL1O75147 1896 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SUV39H1O43463 412 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 UGDHO60701 494 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SEMG1P04279 462 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GSTM1P09488 218 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GADD45AP24522 165 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 S100A5P33763 92 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 BDKRB1P46663 353 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 DEFA1P59665 94 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 DEFA3P59666 94 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF45Q02386 682 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NPRL3Q12980 569 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 KCNC3Q14003 757 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 POM121L1PQ3SYA9 428 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 AHSA2Q719I0 299 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SYNPOQ8N3V7 929 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SPERTQ8NA61 448 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CDADC1Q9BWV3 514 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SIRT5Q9NXA8 310 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 EHD3Q9NZN3 535 aa12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN6O43657 245 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SGTAO43765 313 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ETHE1O95571 254 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 C9P02748 559 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 UBL4AP11441 157 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 VIPR1P32241 457 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 KRT20P35900 424 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ITGA1P56199 1179 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TUBA1BP68363 451 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GPLD1P80108 840 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CREMQ03060 361 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 PRKCDQ05655 676 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 VEZF1Q14119 521 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 BCL7AQ4VC05 210 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TUBA1AQ71U36 451 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 TMC8Q8IU68 726 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SPPL2AQ8TCT8 520 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SLC38A4Q969I6 547 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NUAK2Q9H093 628 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SLCO2B1O94956 709 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA3DO95025 777 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CATP04040 527 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 XPAP23025 273 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RRM2P31350 389 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 HNF4AP41235 474 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CRATP43155 626 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 ASMTP46597 345 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GRHL2Q6ISB3 625 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 GPR153Q6NV75 609 aa12.66□□□□□ -0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NAGSQ8N159 534 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms