RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DMAP28067 261 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GGT5P36269 586 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GATMP50440 423 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA1P56199 1179 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL10RBQ08334 325 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPR17Q13304 367 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0040Q15053 153 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PARP15Q460N3 678 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf22Q49AR2 442 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF605Q86T29 641 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RNF130Q86XS8 419 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR8H2Q8N162 312 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 STX19Q8N4C7 294 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T11Q8NH01 316 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TBATAQ96M53 351 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SMOQ99835 787 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NIPAL2Q9H841 368 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ASAH2Q9NR71 780 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPG21Q9NZD8 308 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 INSL6Q9Y581 213 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 VWA8A3KMH1 1905 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 COL4A6Q14031 1691 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 E5RI56 91 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CCRL2O00421 344 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMDEC1O15204 470 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GJB5O95377 273 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ESR1P03372 595 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SOD2P04179 222 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ANXA8P13928 327 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A4P14672 509 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BPIP17213 487 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CYP2A7P20853 494 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GADD45AP24522 165 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA8P32881 189 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 S100A3P33764 101 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RGS6P49758 472 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DAPP51397 102 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB103AP81534 67 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IL1RL1Q01638 556 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2H2Q13888 395 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2H3Q13889 308 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 VEZF1Q14119 521 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GPAT3Q53EU6 434 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BADQ92934 168 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.93□□□□□ -1.3
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