RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, human

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRC-204	ENST00000367379	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	HES3	Q5TGS1	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SHC3	Q92529	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FGF11	Q92914	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FBXO17	Q96EF6	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SYT5	O00445	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DAB1	O75553	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CLDN14	O95500	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	METTL18	O95568	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ADCY5	O95622	1261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RHOC	P08134	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SRC	P12931	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ACP1	P24666	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PON1	P27169	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	OR1E1	P30953	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CHRNA3	P32297	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DRD3	P35462	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CDKN1A	P38936	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PTPN9	P43378	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ACADVL	P49748	655 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ATP12A	P54707	1039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SGCG	Q13326	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	WNT9B	O14905	357 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	SCAMP1	O15126	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	SDC3	O75056	442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	SLC22A3	O75751	556 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPRC-204	ENST00000367379	AMBP	P02760	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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