RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 MT-ND2P03891 347 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RB1P06400 928 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 EPHX1P07099 455 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IDSP22304 550 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IMPA1P29218 277 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IL12RB1P42701 662 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVK-21P61565 698 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RGNQ15493 299 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 VITQ6UXI7 678 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM159Q96B96 161 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 EPYCQ99645 322 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 HCN2Q9UL51 889 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC5A10A0PJK1 596 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAM23O75077 832 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIBP23284 216 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC13P55735 322 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 NPRL3Q12980 569 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 CLCA4Q14CN2 919 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 SYTL3Q4VX76 610 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS37AQ8NEZ2 397 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2FQ969M7 185 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PKP4Q99569 1192 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPRE3Q9UPY8 281 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 SDK1Q7Z5N4 2213 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN11A1L157 253 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CATP04040 527 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HPCAL1P37235 193 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MMP12P39900 470 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 BDKRB1P46663 353 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GAB1Q13480 694 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 E2F2Q14209 437 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DMC1Q14565 340 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP6Q16828 381 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 HKDC1Q2TB90 917 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PROX2Q3B8N5 592 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA8L1Q5VT79 327 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 NDNFQ8TB73 568 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 KLK6Q92876 244 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF14Q92915 247 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT13Q9NPJ3 140 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R3G1 203 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TOR1BO14657 336 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS10O43665 173 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 WBP4O75554 376 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MFSD4AQ8N468 514 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MAL2Q969L2 176 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TAMM41Q96BW9 452 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD18Q9NS91 495 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SUV39H1O43463 412 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG13O75143 517 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PCGF2P35227 344 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT20P35900 424 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PRLHRP49683 370 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DGUOKQ16854 277 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SPIN4Q56A73 249 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PARM1Q6UWI2 310 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SVOPQ8N4V2 548 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS35Q96QK1 796 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CCM2Q9BSQ5 444 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A17Q9H1V8 727 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2AG1Q9H205 316 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 INIPQ9NRY2 104 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 GIN1Q9NXP7 522 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 KRBA1A5PL33 1030 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA12O60330 932 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM20BO75063 409 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FCARP24071 287 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 IFITM3Q01628 133 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 MVKQ03426 396 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF284Q2VY69 593 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS48Q7RTY5 328 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms