RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355653.7

VAT1-201, Transcript of vesicle amine transport 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAT1, Length 2,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1-201ENST00000355653 ETFAP13804 333 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GKP32189 559 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CHIT1Q13231 466 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CHRNA6Q15825 494 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HKDC1Q2TB90 917 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 IFI44LQ53G44 452 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 COX20Q5RI15 118 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TMEM203Q969S6 136 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HHIPQ96QV1 700 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 RNF121Q9H920 327 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 RDH14Q9HBH5 336 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PCM1Q15154 2024 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 MEN1O00255 615 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ARHGEF15O94989 841 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 SCG5P05408 212 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CSF3P09919 207 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TSPAN19P0C672 248 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 NAT1P18440 290 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 EFR3AQ14156 821 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 MYO19Q96H55 970 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PLXNA3P51805 1871 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 AKR7A2O43488 359 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 DPM1O60762 260 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ZNF623O75123 536 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CSO75390 466 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CLDN11O75508 207 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 AP2A2O94973 939 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 OAZ2O95190 189 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CD160O95971 181 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HIST1H2ADP20671 130 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 DUSP7Q16829 419 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CPTPQ5TA50 214 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 STMN3Q9NZ72 180 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.64□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 A0A1W2PQ72 361 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GABRR3A8MPY1 467 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 SMLR1H3BR10 107 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ARHGEF9O43307 516 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GJB5O95377 273 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 SOX14O95416 240 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CHMP24386 653 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PCGF2P35227 344 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 KIR2DL3P43628 341 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 FAPQ12884 760 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ASAH1Q13510 395 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 QPRTQ15274 297 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GPR65Q8IYL9 337 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 COQ7Q99807 217 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CHST8Q9H2A9 424 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 GKN1Q9NS71 199 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 K7ERQ8 282 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 AOAHP28039 575 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 OR3A3P47888 321 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 NKX3-2P78367 333 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 SPHARQ15513 63 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.63□□□□□ -0.07
VAT1-201ENST00000355653 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms