RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 LMO7DNF2Z398 122 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZW10O43264 779 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AQP9O43315 295 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MAGP20916 626 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RHDQ02161 417 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C2orf80Q0P641 193 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF385BQ569K4 471 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GBP5Q96PP8 586 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PHF12Q96QT6 1004 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR5K3A6NET4 321 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NOBOXO60393 691 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TBX19O60806 448 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 IL3P08700 152 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MAPK12P53778 367 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C21orf59P57076 290 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MC1RQ01726 317 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CYP4F3Q08477 520 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 FCRL6Q6DN72 434 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SPATA24Q86W54 205 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OOSP2Q86WS3 158 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ARL14Q8N4G2 192 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF583Q96ND8 569 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PANX1Q96RD7 426 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GMEB1Q9Y692 573 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0A6YYD5 115 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AQP12BA6NM10 295 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PPM1DO15297 605 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TMPRSS11DO60235 418 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PIAS2O75928 621 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 STAMBPO95630 424 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SERPIND1P05546 499 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ATP6V1B2P21281 511 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PAX7P23759 505 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 KLC1Q07866 573 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 IFNEQ86WN2 208 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR2L5Q8NG80 312 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NT5CQ8TCD5 201 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PPCDCQ96CD2 204 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 THAP11Q96EK4 314 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR2A5Q96R48 311 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ECSITQ9BQ95 431 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 KLHL31Q9H511 634 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.74□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TECTAO75443 2155 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0J9YY10 115 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C4orf51C9J302 202 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ARPC2O15144 300 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CTSVO60911 334 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GSNP06396 782 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DDCP20711 480 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LSSP48449 732 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PLA2G16P53816 162 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MPEG1Q2M385 716 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MUM1Q2TAK8 710 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PMS2CLQ68D20 193 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms