RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZIC1Q15915 447 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NKG7Q16617 165 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CPZQ66K79 652 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ERICH5Q6P6B1 374 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT13Q86X67 352 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NETO1Q8TDF5 533 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZFP90Q8TF47 636 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 BATF3Q9NR55 127 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GMEB1Q9Y692 573 aa11.89□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C7orf72A4D263 438 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 BTN3A3O00478 584 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PRKD3O94806 890 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KCNK5O95279 499 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SERPINA1P01009 418 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 STATHP02808 62 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PDK3Q15120 406 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 VMACQ2NL98 169 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SPRED1Q7Z699 444 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PTOV1Q86YD1 416 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FRMD1Q8N878 549 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RLN3Q8WXF3 142 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TPSD1Q9BZJ3 242 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 AICDAQ9GZX7 198 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OLAHQ9NV23 265 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KLF15Q9UIH9 416 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMPRSS11DO60235 418 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 LYNP07948 512 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT1P36639 197 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 HBA1P69905 142 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF425Q6IV72 752 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CBR4Q8N4T8 237 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FAM47BQ8NA70 645 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 VPS50Q96JG6 964 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CHST8Q9H2A9 424 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 YY1AP1Q9H869 796 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GPR27Q9NS67 375 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SNX7Q9UNH6 387 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0G2JN53 185 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PPC4 97 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KRBA1A5PL33 1030 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 LRIT2A6NDA9 550 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PDLIM1O00151 329 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CLOCKO15516 846 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TBX19O60806 448 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 THEGLP0DJG4 465 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DDCP20711 480 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GSTM2P28161 218 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FZD5Q13467 585 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FZD2Q14332 565 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PLCL1Q15111 1095 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ORAI3Q9BRQ5 295 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FOXQ1Q9C009 403 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MAGIXQ9H6Y5 334 aa11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms