RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 DSCR3O14972 297 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PTTG1O95997 202 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PTGS2P35354 604 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 HTR3AP46098 478 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CXCR4P61073 352 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB103AP81534 67 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ELP6Q0PNE2 266 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 C5orf22Q49AR2 442 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SERPINA11Q86U17 422 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 AMER2Q8N7J2 671 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 INPPL1O15357 1258 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PCDH7O60245 1069 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 NAT2P11245 290 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 MAPK1P28482 360 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 OR3A3P47888 321 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ST3GAL4Q11206 333 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 FAM26DQ5JW98 314 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 RETSATQ6NUM9 610 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CBLL1Q75N03 491 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF605Q86T29 641 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 NAGSQ8N159 534 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 MMP28Q9H239 520 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CLEC4EQ9ULY5 219 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.61□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 OR2AG2A6NM03 316 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CSF2P04141 144 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CSF2RAP15509 400 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CBLP22681 906 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 AOAHP28039 575 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ITGA1P56199 1179 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ABRQ12979 859 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 OR10G2Q8NGC3 310 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 OR5AK3PQ8NH89 298 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 MMP27Q9H306 513 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CLDN24A6NM45 220 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CTDSP2O14595 271 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ARHGEF9O43307 516 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PRPS1L1P21108 318 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 IL12RB1P42701 662 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SLC15A1P46059 708 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 WNT3P56703 355 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 B4GALNT1Q00973 533 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 GAB1Q13480 694 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 RAB43Q86YS6 212 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 LACC1Q8IV20 430 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 TESCQ96BS2 214 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 TCF25Q9BQ70 676 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 DUSP26Q9BV47 211 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 FAM227AF5H4B4 570 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ETFAP13804 333 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 PSMA3P25788 255 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 NSG1P42857 185 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CRYBA2P53672 197 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 SLAMF1Q13291 335 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 Q5BKY6 102 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 CHST9Q7L1S5 443 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 OR5M11Q96RB7 305 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 MS4A12Q9NXJ0 267 aa11.6□□□□□ -0.55
NLRC3-201ENST00000324659 ASIC5Q9NY37 505 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms