RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 CREB3L4Q8TEY5 395 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 MIEF2Q96C03 454 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SMIM10Q96HG1 83 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CNDP1Q96KN2 507 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 LMF1Q96S06 567 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SLC6A16Q9GZN6 736 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 C14orf105Q9NVL8 296 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 WWOXQ9NZC7 414 aa24.12■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 MYBL2P10244 700 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ACPPP15309 386 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TYK2P29597 1187 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CASP2P42575 452 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 HSPA7P48741 367 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 EFNA3P52797 238 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 OCA2Q04671 838 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ESAMQ96AP7 390 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CD244Q9BZW8 370 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 AICDAQ9GZX7 198 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CD274Q9NZQ7 290 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TRPC4Q9UBN4 977 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 FETUBQ9UGM5 382 aa24.11■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 MAP2K7O14733 419 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 LRRTM2O43300 516 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 KLHL18O94889 574 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CYC1P08574 325 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 AVPR1BP47901 424 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 PER3P56645 1201 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 C1QL3Q5VWW1 255 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SHISA5Q8N114 240 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TBC1D19Q8N5T2 526 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TRPV3Q8NET8 790 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 C3orf18Q9UK00 162 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.1■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 UBXN8O00124 270 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 NDUFS4O43181 175 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 KRT38O76015 456 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 BMP10O95393 424 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 GSTM2P28161 218 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SOX11P35716 441 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 MSH2P43246 934 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 HERC3Q15034 1050 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TBCCQ15814 346 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SYT16Q17RD7 645 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 FBXO48Q5FWF7 155 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ADGRD1Q6QNK2 874 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TIFABQ6ZNK6 161 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 LINC00696Q6ZRV3 163 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SLC34A3Q8N130 599 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ZNF160Q9HCG1 818 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 APCP25054 2843 aa24.09■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SYCE1LA8MT33 242 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 PCDH17O14917 1159 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 WFS1O76024 890 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 SERPINA6P08185 405 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 STSP08842 583 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 COX6A1P12074 109 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 COL6A2P12110 1019 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 IL1RNP18510 177 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CD22P20273 847 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 CXCR2P25025 360 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 PDK4Q16654 411 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 TECRLQ5HYJ1 363 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 FAM180AQ6UWF9 173 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 PSMF1Q92530 271 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 C8orf44Q96CB5 159 aa24.08■■□□□ 1.45
RP9-201ENST00000297157 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 IDSB3KWA1 339 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 FFAR3O14843 346 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 GPR42O15529 346 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 AGTR2P50052 363 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 SETDB1Q15047 1291 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 ADPRMQ3LIE5 342 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 TMEM205Q6UW68 189 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 KBTBD2Q8IY47 623 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 PRSS58Q8IYP2 241 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 BCORP1Q8N888 145 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 TTLQ8NG68 377 aa24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RP9-201ENST00000297157 ANKHQ9HCJ1 492 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms