RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 TMEM184CQ9NVA4 438 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GPATCH2Q9NW75 528 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.893e-10■□□□□ 8.7
UBP1-201ENST00000283628 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TAF4O00268 1085 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CTSCP53634 463 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 HBA1P69905 142 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF385BQ569K4 471 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CADM3Q8N126 398 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GGHQ92820 318 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GLYATL1Q969I3 302 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NEIL2Q969S2 332 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ARMC5Q96C12 935 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SLC35A5Q9BS91 424 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa26.88■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SH3BGRLO75368 114 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ETFAP13804 333 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SLC19A1P41440 591 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SPIBQ01892 262 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SCARB2Q14108 478 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 OXR1Q8N573 874 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PROX1Q92786 737 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 WDR34Q96EX3 536 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZBP1Q9H171 429 aa26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 METTL15A6NJ78 407 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SAGE2PA6NJ88 616 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 LEFTY1O75610 366 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TIMP2P16035 220 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 COX20Q5RI15 118 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CATSPEREQ5SY80 951 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TMPRSS11BQ86T26 416 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF605Q86T29 641 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ADIPOR2Q86V24 386 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CCDC103Q8IW40 242 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FOXJ1Q92949 421 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 IFNA14P01570 189 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TGFBR1P36897 503 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 DNASE1L3Q13609 305 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PDE7AQ13946 482 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TRIM40Q6P9F5 258 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NLRP8Q86W28 1048 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 LGI4Q8N135 537 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 AMER2Q8N7J2 671 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 COL21A1Q96P44 957 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB11Q9BUY7 163 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EHD1Q9H4M9 534 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 SP140LQ9H930 580 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ENOPH1Q9UHY7 261 aa26.86■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 OPN1SWP03999 348 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GABRB1P18505 474 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GSSP48637 474 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CDH12P55289 794 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 DPPA4Q7L190 304 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF675Q8TD23 568 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF556Q9HAH1 456 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CCL26Q9Y258 94 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 AQP9O43315 295 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 UPK1BO75841 260 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GADD45AP24522 165 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PRIM2P49643 509 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 CDC20Q12834 499 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF852Q6ZMS4 543 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 COMMD6Q7Z4G1 85 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 LAS2Q8IYD9 372 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 KBTBD8Q8NFY9 601 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 OR4K1Q8NGD4 311 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ASAH2Q9NR71 780 aa26.85■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 PCM1Q15154 2024 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 GPR37L1O60883 481 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FGF18O76093 207 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 C6orf47O95873 294 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 FURINP09958 794 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 IDH2P48735 452 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 OLR1P78380 273 aa26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
UBP1-201ENST00000283628 ZNF181Q2M3W8 571 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms