RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272322.8

VPS54-201, Transcript of VPS54, GARP complex subunit, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene VPS54, Length 3,463 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS54-201ENST00000272322 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.95■□□□□ 0.14
VPS54-201ENST00000272322 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.95■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.94■□□□□ 0.14
VPS54-201ENST00000272322 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.94■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.94■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 ATL1Q8WXF7 558 aa15.94■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.94■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 OR8J2Q8NGG1 315 aa15.93■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.93■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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VPS54-201ENST00000272322 CDK6Q00534 326 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS54-201ENST00000272322 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS54-201ENST00000272322 SP140Q13342 867 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS54-201ENST00000272322 INAQ16352 499 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS54-201ENST00000272322 DEF8Q6ZN54 512 aa15.92■□□□□ 0.14
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