RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.1■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.1■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.1■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.1■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.1■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 PCDH17O14917 1159 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 PIP5K1BO14986 540 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 KPNA5O15131 536 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CACNG3O60359 315 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ECDO95905 644 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 FGF4P08620 206 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CASP2P42575 452 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CAMK1Q14012 370 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 VEPH1Q14D04 833 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 Q3ZCU0 254 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 LCN1P1Q5VSP4 162 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 FAM131AQ6UXB0 335 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CHPFQ8IZ52 775 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 STX19Q8N4C7 294 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 APH1BQ8WW43 257 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ASB12Q8WXK4 309 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ADAM30Q9UKF2 790 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 DTX4Q9Y2E6 619 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CMAHPQ9Y471 501 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 COMMD10Q9Y6G5 202 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 PQLC2LA1A4F0 135 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MFSD2BA6NFX1 497 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 HMBSP08397 361 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ZNF33AQ06730 810 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 FGFBP1Q14512 234 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 DPP10Q8N608 796 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 RBP7Q96R05 134 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MARVELD1Q9BSK0 173 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 CDH23Q9H251 3354 aa21.09■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PPL8 197 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MATN3O15232 486 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 ORC5O43913 435 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 RPA4Q13156 261 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 MLIPQ5VWP3 458 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 RASSF1Q9NS23 344 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 SDHAF2Q9NX18 166 aa21.08■□□□□ 0.97
PITX1-201ENST00000265340 VPS4BO75351 444 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 HLA-DQB2P05538 268 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 PLK1P53350 603 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 IQCCQ4KMZ1 466 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 MZT2BQ6NZ67 158 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 PHF21BQ96EK2 531 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 TEX37Q96LM6 180 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 COL21A1Q96P44 957 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 PITX2Q99697 317 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 TTPALQ9BTX7 342 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 ZFP64Q9NPA5 681 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa21.08■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 ST8SIA5O15466 376 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 GATCO43716 136 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 FGBP02675 491 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 FAM157BP0CG42 384 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 GPC1P35052 558 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 DAPP51397 102 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 IGSF8Q969P0 613 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D20Q96BZ9 403 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 CRELD1Q96HD1 420 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 BARHL1Q9BZE3 327 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 GLOD4Q9HC38 313 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.07■□□□□ 0.96
PITX1-201ENST00000265340 MBD2Q9UBB5 411 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms